Salut,
Non, tu n'auras pas de perte au niveau des perfs. Ceci dit, installer un Systeme d'exploitation dans une partition étendu n'est pas trés recommandé... (je passe les détails techniques...)
Il est vivement conseillé d'installer un O.S. dans une partition principal. Si tu as l'intention d'en installer plusieurs, il te faudra créer une autre partition principal avec un logiciel spécialisé. (Partition magic, ou l'outil de partionnement des O.S récents).
Voila.